O PPGCONT se organiza em uma área de concentração (Controladoria) estruturada em duas linhas de pesquisa, a saber:
- Contabilidade Financeira; e
- Contabilidade Gerencial.
A linha de pesquisa em Contabilidade Financeira compreende investigações relacionadas às questões basilares e emergentes da contabilidade no campo da evidenciação corporativa, julgamento e tomada de decisão em contabilidade e o papel da informação contábil para o mercado de capital, abordando temas sobre o valor relevância da informação contábil, qualidade da informação contábil, gerenciamento de resultados, instrumentos contábeis de evidenciação e accoutanbility da responsabilidade econômica, social e ambiental das instituições, regulação contábil, auditoria, tributação, contabilidade aplicada às questões de entidades públicas e do terceiro setor, bem como estudos de temas educacionais relacionados à área de contabilidade financeira.
Por sua vez, a linha de pesquisa em Contabilidade Gerencial engloba investigações sobre a elaboração e comunicação de informações pertinentes ao processo de tomada de decisão e o incentivo e controle dentro das organizações, desdobrando-se em estudos que envolvem a contabilidade de custos, contabilidade decisorial, planejamento empresarial, controles estratégicos e operacionais de gestão, sistemas de controle gerencial, gestão socioambiental, gestão de custos da cadeia logística, determinantes econômicos e comportamentais dos sistemas de controle, avaliação de desempenho e feedback, além de pesquisas na área de educação.